O erro E303 - O Documento XML difere da assinatura (GINFES) pode ocorrer devido ao seguinte fator:

• Quando efetua-se alguma alteração no arquivo XML após a assinatura.

Como resolver

Após realizar a assinatura do arquivo XML esse não poderá ser alterado quando o envio for realizado. Realize as alterações no arquivo antes de assinar o XML com o certificado digital.